More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6565 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  99.27 
 
 
546 aa  1101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
546 aa  1105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
546 aa  1105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  45.08 
 
 
535 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  43.31 
 
 
560 aa  405  1e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 
555 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
546 aa  308  1e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  36.56 
 
 
541 aa  306  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
511 aa  303  8e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  35.81 
 
 
537 aa  296  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  35.21 
 
 
542 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  35.5 
 
 
537 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  34.98 
 
 
551 aa  245  2e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.87 
 
 
550 aa  235  2e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
532 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 
551 aa  221  2e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  32.81 
 
 
553 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 
558 aa  197  5e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 
560 aa  196  8e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 
564 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 
547 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
535 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 
544 aa  184  4e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.49 
 
 
542 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
545 aa  181  3e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 
557 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
517 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.34 
 
 
539 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.16 
 
 
554 aa  174  3e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
557 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.62 
 
 
543 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  31.11 
 
 
542 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  33.5 
 
 
488 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 
554 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.26 
 
 
562 aa  167  3e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
545 aa  167  6e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
543 aa  166  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
587 aa  165  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
556 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  33.5 
 
 
524 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.46 
 
 
530 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
541 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
547 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.47 
 
 
520 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.41 
 
 
538 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 
534 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.26 
 
 
524 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  29 
 
 
526 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29 
 
 
526 aa  158  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.6 
 
 
509 aa  157  5e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 
562 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.45 
 
 
531 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
517 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.7 
 
 
513 aa  154  3e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.77414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.54 
 
 
535 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.07 
 
 
526 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.29 
 
 
516 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.04 
 
 
544 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  5.91223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.64 
 
 
540 aa  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
519 aa  153  9e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.57 
 
 
524 aa  153  9e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
492 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 
502 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.52 
 
 
531 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
521 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.51 
 
 
521 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.51 
 
 
521 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.51 
 
 
521 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.06 
 
 
524 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
531 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.16 
 
 
524 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.35 
 
 
524 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.35 
 
 
524 aa  151  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.35 
 
 
524 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 
554 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  29.35 
 
 
524 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.33 
 
 
521 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  29.35 
 
 
524 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.35 
 
 
524 aa  149  1e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
528 aa  149  1e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.25 
 
 
524 aa  149  1e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  29.7 
 
 
539 aa  148  2e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  28.99 
 
 
551 aa  148  2e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 
548 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.37 
 
 
546 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
528 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 
495 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
544 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.46 
 
 
492 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.46 
 
 
479 aa  147  7e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.89 
 
 
524 aa  146  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 
499 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.03 
 
 
508 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  26.83 
 
 
532 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
539 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.05 
 
 
541 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 
534 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
505 aa  144  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.83 
 
 
529 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.35 
 
 
525 aa  142  1e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>