More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1003 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  83.81 
 
 		 379 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  83.55 
 
 		 379 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  100 
 
 		 383 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  83.81 
 
 		 379 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  83.55 
 
 		 379 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  99.48 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  99.73 
 
 		 374 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  83.81 
 
 		 379 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  84.07 
 
 		 379 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  77.34 
 
 		 381 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  76.24 
 
 		 379 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  77.28 
 
 		 380 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  76.5 
 
 		 380 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  71.09 
 
 		 381 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  70.05 
 
 		 381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  70.39 
 
 		 381 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  57.62 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  58.98 
 
 		 376 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  54.85 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  53.59 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  54.25 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  53.55 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  53.42 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  52.76 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  55 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  53.81 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  52.76 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  52.76 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  52.51 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  52.51 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  53.67 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  52.51 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  52.51 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.93 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  53.42 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  54.18 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  52.53 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  53.67 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  52.66 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  52.91 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.82 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  53.92 
 
 		 379 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  52.41 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  52.39 
 
 		 411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  51.39 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  51.39 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  51.39 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  54.93 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  51.39 
 
 		 384 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  51.39 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  49.75 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  51.52 
 
 		 383 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  50.25 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  54.5 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.23 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50.76 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  50.25 
 
 		 409 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  50.25 
 
 		 409 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  50.25 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  47.1 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.62 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.91 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  50.38 
 
 		 375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  50.88 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.61 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  48.95 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  50.13 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  52.03 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.6 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  50.25 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  50.25 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  52.03 
 
 		 374 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.47 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  48.4 
 
 		 385 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  51.54 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  51.54 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  51.54 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  51.01 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  50.26 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  50.26 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  50.26 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  47.71 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  50.25 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  46.23 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  50.25 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  50 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  52.56 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  45.76 
 
 		 377 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  46.17 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  51.28 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  50.37 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>