271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3613 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  873    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  49.74 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  45.24 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  43.92 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.77 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.49 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.72 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 429 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.42 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.22 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.04 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.1 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.36 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.07 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  27.83 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.85 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  30.21 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.07 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.78 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.84 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.36 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>