More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3029 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  71.53 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  66.44 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  65.75 
 
 		 297 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  62.2 
 
 		 291 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  60.62 
 
 		 292 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  59.39 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  55.74 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  55.18 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.98 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 		 292 aa  291  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  53.99 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  55.07 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  53.77 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  52.03 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  53.38 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  53.9 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  53.38 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.79 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.33 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.79 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.76 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  37.46 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  34.74 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.91 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  33.67 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  33.67 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  31.91 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  33.22 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.12 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  34.02 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  35.39 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.46 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.1 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  32.25 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.02 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  35.2 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.04 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32.29 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  32.04 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.67 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  32.47 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  30.16 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  30.82 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.91 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  34.98 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  31.74 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.13 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  42.01 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  32.16 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  33.44 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.93 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.93 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.69 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.74 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  36.6 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  32.89 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 242 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  32.79 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.79 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>