More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4768 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4768  porin  100 
 
 		 384 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  90.67 
 
 		 386 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  91.67 
 
 		 383 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  96.89 
 
 		 386 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  87.31 
 
 		 385 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  87.31 
 
 		 385 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  87.05 
 
 		 385 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  79.02 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  78.5 
 
 		 424 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  78.76 
 
 		 382 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  78.76 
 
 		 382 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  72.56 
 
 		 384 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  71.07 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  67.86 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  67.38 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  60.81 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  55.3 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  53.23 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  83.54 
 
 		 278 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  46.55 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.31 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.55 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.55 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.55 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.55 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.55 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.65 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.65 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.31 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.15 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.9 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.95 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.7 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.8 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  47.04 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.26 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  45.81 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  47.81 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  46.13 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  45.57 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  46.82 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  46.82 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  46.82 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.58 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.45 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  46.45 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.45 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  47.2 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.7 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  45.1 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.72 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  46.67 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  46.39 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.19 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  44.09 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  45.07 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.72 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.72 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.47 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.47 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.09 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.47 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  45.54 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  45.1 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.47 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  45.54 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  45.54 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  44.31 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  45.3 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  45.3 
 
 		 379 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.21 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.21 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.21 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.21 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.02 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.45 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.23 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  45.32 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.2 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  44.77 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  44.09 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.72 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.81 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.47 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  46.09 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.66 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  46.91 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.26 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.26 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.04 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  46.19 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  45.83 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  45.74 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  45.57 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  45.57 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  45.34 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.1 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  44.74 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  42.16 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  43 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>