More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1281 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  316  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  98.08 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 157 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  90.32 
 
 		 156 aa  287  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  86.54 
 
 		 156 aa  279  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  88.96 
 
 		 167 aa  277  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  77.63 
 
 		 158 aa  237  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 157 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  69.86 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  68.24 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 152 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  55.78 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 340 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  33.05 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.94 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.6 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.98 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  45 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  38.36 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.27 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.27 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  42.59 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  42.37 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.62 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  32.56 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  26.89 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.89 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  27.27 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  27.41 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  37.35 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.89 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.87 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  37.04 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>