More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0112 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  99.27 
 
 
409 aa  828  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  99.76 
 
 
414 aa  833  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
409 aa  834  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  83.54 
 
 
409 aa  692  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  73.66 
 
 
410 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  60.3 
 
 
399 aa  468  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  57.64 
 
 
404 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  48.62 
 
 
440 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  51.65 
 
 
392 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3184e-11 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  44.1 
 
 
410 aa  306  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  41.09 
 
 
403 aa  305  1e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  36.27 
 
 
418 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  36.27 
 
 
418 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  37.47 
 
 
402 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  36.75 
 
 
418 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  36.39 
 
 
400 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  36.88 
 
 
418 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  36.79 
 
 
402 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  36.36 
 
 
395 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  35.93 
 
 
418 aa  254  2e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  36.39 
 
 
398 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  35.52 
 
 
418 aa  252  9e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  37.84 
 
 
418 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  36.39 
 
 
399 aa  249  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  39.69 
 
 
389 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  35.75 
 
 
434 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  37.16 
 
 
417 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  37.41 
 
 
415 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  35.11 
 
 
400 aa  245  1e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  7.70896e-14  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  36.96 
 
 
418 aa  244  1e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  36.43 
 
 
418 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  35.88 
 
 
395 aa  243  4e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  34.52 
 
 
426 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  35.51 
 
 
455 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  36.25 
 
 
390 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  35.49 
 
 
446 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.32 
 
 
404 aa  236  5e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.32 
 
 
404 aa  236  5e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.32 
 
 
404 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  35.47 
 
 
394 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.31 
 
 
404 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  34.65 
 
 
394 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  37.24 
 
 
445 aa  232  7e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  36.68 
 
 
418 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  36.34 
 
 
418 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  35.15 
 
 
418 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.27 
 
 
421 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  35.93 
 
 
402 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  35.11 
 
 
404 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  35.55 
 
 
410 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  32.75 
 
 
404 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.58 
 
 
404 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.75 
 
 
404 aa  222  1e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  33 
 
 
406 aa  222  1e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  34.7 
 
 
428 aa  221  1e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.02 
 
 
396 aa  221  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  34.92 
 
 
429 aa  221  2e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  33.58 
 
 
395 aa  221  2e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  34.85 
 
 
414 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.02 
 
 
394 aa  219  8e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.76 
 
 
394 aa  219  9e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  35.5 
 
 
413 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.11 
 
 
395 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  33.08 
 
 
403 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  34.17 
 
 
397 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  36.19 
 
 
439 aa  214  2e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.25 
 
 
402 aa  212  8e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  31.99 
 
 
398 aa  212  8e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  33.51 
 
 
396 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.5 
 
 
419 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  33.5 
 
 
394 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.75 
 
 
404 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  35.73 
 
 
420 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  2.99734e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  34.1 
 
 
404 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  35.49 
 
 
419 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  35.29 
 
 
461 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.91 
 
 
409 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  34.33 
 
 
462 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  33.58 
 
 
413 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  35.73 
 
 
422 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  30.32 
 
 
410 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  33.85 
 
 
417 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  35.07 
 
 
395 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  31.67 
 
 
416 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  33.75 
 
 
400 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  34.86 
 
 
401 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  34.11 
 
 
387 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  32.99 
 
 
396 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  36.55 
 
 
420 aa  206  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.5 
 
 
405 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  32.5 
 
 
395 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.36 
 
 
404 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.94 
 
 
420 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  32.32 
 
 
409 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  34.19 
 
 
401 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  32.16 
 
 
414 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.33 
 
 
402 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.91 
 
 
391 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  32.78 
 
 
419 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>