More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0082 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  69.03 
 
 
339 aa  497  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  69.79 
 
 
334 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0094  regulatory protein  96.68 
 
 
211 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  45.99 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
425 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
364 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
389 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
389 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
385 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
398 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 
339 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 
339 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 
382 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
398 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 
341 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 
364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
338 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 
345 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 
370 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
360 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
366 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
343 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 
366 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
364 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
366 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  27.13 
 
 
339 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
366 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
352 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.44 
 
 
339 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
345 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
372 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
343 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.69 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.88 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.75 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.36 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  28.75 
 
 
365 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 
396 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  29.24 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  27.25 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  28.28 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
359 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 
364 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>