More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1053 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1189    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  99.83 
 
 
583 aa  1189    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  50.17 
 
 
585 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  50.55 
 
 
580 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  50.27 
 
 
580 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  38.17 
 
 
565 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.6 
 
 
569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  31.67 
 
 
541 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.57 
 
 
542 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.46 
 
 
537 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.66 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.98 
 
 
545 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 
601 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  31.83 
 
 
560 aa  209  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.57 
 
 
574 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.59 
 
 
535 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  31.59 
 
 
543 aa  206  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  30.55 
 
 
558 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
530 aa  203  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.05 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  28.98 
 
 
613 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.34 
 
 
565 aa  200  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 
608 aa  200  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
543 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  29.75 
 
 
574 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.1 
 
 
569 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.93 
 
 
573 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
548 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 
532 aa  180  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.32 
 
 
542 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.26 
 
 
589 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.82 
 
 
552 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
573 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
569 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.95 
 
 
564 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
538 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
564 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  28.38 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.56 
 
 
550 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  26.37 
 
 
576 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.2 
 
 
565 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
556 aa  169  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.94 
 
 
596 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.89 
 
 
546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.4 
 
 
580 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.07 
 
 
560 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  28.86 
 
 
548 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  28.86 
 
 
548 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  28.86 
 
 
548 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.47 
 
 
557 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 
553 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
553 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 
536 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.84 
 
 
568 aa  156  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.43 
 
 
522 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.86 
 
 
576 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  26.7 
 
 
620 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  25.96 
 
 
560 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 
544 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 
544 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 
536 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.2 
 
 
560 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 
616 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.52 
 
 
603 aa  151  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.77 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.39 
 
 
540 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27.39 
 
 
544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.41 
 
 
547 aa  147  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.49 
 
 
520 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
556 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.83 
 
 
537 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.76 
 
 
564 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.45 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  27.23 
 
 
563 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  27.39 
 
 
563 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.07 
 
 
563 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.9 
 
 
548 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.29 
 
 
541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  26.12 
 
 
583 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  26.12 
 
 
583 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
550 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.83 
 
 
563 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.74 
 
 
522 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  26.88 
 
 
550 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 
543 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.88 
 
 
522 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 
584 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  25.13 
 
 
529 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.09 
 
 
522 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.9 
 
 
539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.09 
 
 
522 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.42 
 
 
522 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  27.62 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.74 
 
 
522 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.56 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.56 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.92 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.34 
 
 
522 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>