More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0368 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0368  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
383 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0352  LysR family transcriptional regulator  98.36 
 
 
304 aa  614  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0454  LysR family transcriptional regulator  93.07 
 
 
304 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4623  LysR family transcriptional regulator  78.95 
 
 
315 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.570776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  71.95 
 
 
306 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2703  LysR family transcriptional regulator  56.19 
 
 
303 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3477  LysR family transcriptional regulator  57.34 
 
 
304 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.281785  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 
298 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3206  transcriptional regulator  53.18 
 
 
327 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.214083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2610  LysR family transcriptional regulator  55.99 
 
 
292 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  46.21 
 
 
310 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 
310 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 
310 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3293  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
337 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352846  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6200  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
309 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.18 
 
 
305 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
325 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
303 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
302 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
298 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
306 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
296 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
299 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.55 
 
 
297 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
298 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.82 
 
 
302 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 
335 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
304 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
310 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 
301 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
314 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
295 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
298 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 
308 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
301 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  36.55 
 
 
303 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
298 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 
312 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
301 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
303 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
295 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
289 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
292 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
301 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
312 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
298 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
301 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1765  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 
298 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389128  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 
298 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
301 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
318 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
294 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
304 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
307 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
298 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  37.37 
 
 
299 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
301 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
313 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
301 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.25 
 
 
304 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.86 
 
 
289 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
307 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
318 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
300 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
307 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
293 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 
300 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
300 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
297 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3341  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
293 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
307 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4825  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
293 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 
318 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
347 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 
307 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
334 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
334 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
334 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 
307 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
362 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
302 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
289 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
294 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
305 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
294 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
305 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
305 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>