More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0689 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  100 
 
 		 459 aa  907    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  74.67 
 
 		 449 aa  655    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  52.01 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  50.23 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  50 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  45.92 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  48.72 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  47.19 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  46.92 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  44.34 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.84 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  43.84 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  46.47 
 
 		 519 aa  346  6e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  41.51 
 
 		 479 aa  332  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  43.07 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  41.86 
 
 		 454 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  43.24 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  41.48 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  39.87 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  43.11 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  41.14 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  41.12 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  38.63 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  41.08 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  43.3 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  40.49 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  40.91 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  38.78 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  40.27 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  40.27 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  40.27 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  38.37 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  39.73 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  36.95 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  36.99 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  38.19 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  37.05 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  38.5 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  34.47 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  34.2 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.09 
 
 		 429 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.15 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.43 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.18 
 
 		 425 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.01 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.01 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.76 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.26 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  33.33 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  33.85 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.82 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.76 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.82 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.82 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.19 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.48 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.85 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.94 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.08 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.74 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.15 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.04 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.17 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.65 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  33.15 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.46 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.02 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.32 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.02 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  32.24 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.03 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.27 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.12 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.39 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.26 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.6 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.54 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  32.37 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  32.37 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  32.37 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  32.37 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  29.97 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.12 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  31.94 
 
 		 434 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.21 
 
 		 433 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  28.26 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.57 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  27.75 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  32.05 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  31.98 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.91 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.77 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.48 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>