More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7247 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  100 
 
 
286 aa  561  1e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
298 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
280 aa  135  1e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.31 
 
 
277 aa  130  2e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  34.26 
 
 
272 aa  130  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
273 aa  129  4e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
278 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
257 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
287 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  32.75 
 
 
281 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
254 aa  121  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
263 aa  122  1e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.79 
 
 
283 aa  121  1e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
258 aa  120  2e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.6 
 
 
272 aa  120  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
269 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 
263 aa  119  5e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
266 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
280 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
266 aa  119  8e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  30.84 
 
 
298 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
259 aa  118  1e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
272 aa  118  1e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
289 aa  116  4e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
291 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.79 
 
 
279 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
257 aa  115  9e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
279 aa  114  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  3.61652e-05 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.52 
 
 
273 aa  114  2e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
315 aa  114  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
271 aa  114  2e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
272 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
273 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  30.66 
 
 
272 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
273 aa  113  4e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
273 aa  113  4e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
281 aa  113  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
274 aa  113  4e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
280 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
267 aa  111  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
279 aa  111  1e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
273 aa  110  2e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
255 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
257 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
283 aa  110  4e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
275 aa  110  4e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.16 
 
 
290 aa  109  4e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
269 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
283 aa  108  9e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
277 aa  108  9e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
256 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
274 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
280 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  27.39 
 
 
282 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
264 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  34.01 
 
 
273 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
264 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1153  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  38.56 
 
 
258 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.23101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
273 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  27.39 
 
 
282 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
253 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
533 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
273 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  30.54 
 
 
256 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
254 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
279 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 
258 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
329 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
275 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
255 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
269 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  30 
 
 
274 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
289 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
269 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
248 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
287 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.65 
 
 
271 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
263 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 
250 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
285 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
255 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  29.58 
 
 
274 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
264 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  33.86 
 
 
304 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
269 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
263 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  31 
 
 
255 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
277 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  30.71 
 
 
289 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
259 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  29.87 
 
 
263 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>