More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  80.74 
 
 
430 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  100 
 
 
432 aa  858    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  80.74 
 
 
462 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  80.34 
 
 
432 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  84.67 
 
 
435 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  80.51 
 
 
430 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  81.41 
 
 
430 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  84.89 
 
 
435 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  69.93 
 
 
422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  69.49 
 
 
424 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  67.14 
 
 
431 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  68.08 
 
 
426 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  67.29 
 
 
429 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  70.38 
 
 
426 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  69.27 
 
 
426 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  69.98 
 
 
426 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  70.34 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  70.34 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  70.31 
 
 
425 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  70.69 
 
 
426 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  70.45 
 
 
426 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  70.45 
 
 
426 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  70.07 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  65.34 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  70.07 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  69.74 
 
 
426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  70.14 
 
 
425 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  64.99 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 
432 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  58.5 
 
 
432 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  60.91 
 
 
440 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  36.32 
 
 
428 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
433 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
433 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  38.34 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  37 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  36.58 
 
 
430 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  37.37 
 
 
430 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  36.84 
 
 
430 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  37.34 
 
 
430 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  37.34 
 
 
430 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  36.84 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  34.78 
 
 
438 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  34.81 
 
 
435 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  33.82 
 
 
432 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
438 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  32.18 
 
 
439 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  28.95 
 
 
437 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  33.99 
 
 
443 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
439 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  33.68 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  33.42 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  31.41 
 
 
442 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  31.41 
 
 
442 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  31.68 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  33.33 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  33.33 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  32.44 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  30.56 
 
 
441 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  31.93 
 
 
434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.39 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
424 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  32.44 
 
 
434 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  31.93 
 
 
434 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  31.93 
 
 
434 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  31.93 
 
 
434 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
439 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  32.23 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  32.23 
 
 
436 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  29.44 
 
 
436 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  32.23 
 
 
436 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  30.32 
 
 
441 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  30.32 
 
 
441 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  32.13 
 
 
428 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  31.88 
 
 
428 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  30.3 
 
 
440 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  33.08 
 
 
440 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  31.94 
 
 
437 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  31.53 
 
 
436 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  30.32 
 
 
441 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  30.07 
 
 
441 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  33.57 
 
 
426 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  30.07 
 
 
441 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  29.88 
 
 
451 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  30.39 
 
 
437 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  33.18 
 
 
459 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0822  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
423 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  33.77 
 
 
443 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  33.25 
 
 
437 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  30.34 
 
 
462 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  29.38 
 
 
437 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  29.78 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
449 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
433 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>