More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0226 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  60.55 
 
 
564 aa  738    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
610 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
607 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
644 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
643 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  59.41 
 
 
684 aa  772    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
614 aa  1276    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
615 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
644 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
643 aa  714    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
611 aa  802    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 
611 aa  790    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
638 aa  704    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
604 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
606 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
644 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
607 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
648 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
608 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
608 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
644 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
635 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
637 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
582 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
636 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
583 aa  610  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
635 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
633 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
582 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
634 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
644 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
636 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  50.25 
 
 
582 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
636 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
645 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
635 aa  598  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
647 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
646 aa  595  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
581 aa  593  1e-168  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
644 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
659 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
639 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
635 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
638 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
637 aa  588  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
634 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
644 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
604 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
631 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
636 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
635 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
637 aa  565  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
637 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
640 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
644 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
637 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
666 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
641 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
638 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
637 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
657 aa  561  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
635 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
658 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
635 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
635 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
690 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
640 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
635 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
640 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
670 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
635 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
640 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
635 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
635 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
669 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
635 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
672 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
635 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
659 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>