223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2348 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  100 
 
 
588 aa  1185    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  76.96 
 
 
585 aa  888    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  56.67 
 
 
608 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  54.25 
 
 
595 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  46.74 
 
 
568 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  46.93 
 
 
568 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  49.19 
 
 
580 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  47.17 
 
 
595 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  45.63 
 
 
584 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.2 
 
 
639 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.4 
 
 
584 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.7 
 
 
1349 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.74 
 
 
1391 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.84 
 
 
1570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  38.6 
 
 
692 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.36 
 
 
585 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  33.52 
 
 
587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.08 
 
 
533 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  30.19 
 
 
579 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  28.4 
 
 
558 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.37 
 
 
567 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.26 
 
 
546 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.73 
 
 
572 aa  124  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  47.97 
 
 
143 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  24.76 
 
 
547 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.24 
 
 
583 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.19 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.11 
 
 
608 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.14 
 
 
583 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25.62 
 
 
582 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 
568 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  25.27 
 
 
602 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.82 
 
 
583 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.35 
 
 
575 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.65 
 
 
541 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.75 
 
 
531 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.44 
 
 
561 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.13 
 
 
585 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  23.35 
 
 
558 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.75 
 
 
549 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  22.96 
 
 
544 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  22.97 
 
 
544 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.03 
 
 
747 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.3 
 
 
554 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.39 
 
 
692 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  24.49 
 
 
531 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.18 
 
 
553 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.27 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.14 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.93 
 
 
554 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.32 
 
 
607 aa  94  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
576 aa  93.6  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.82 
 
 
543 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.71 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.64 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  24.95 
 
 
537 aa  91.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  24.9 
 
 
555 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  24.77 
 
 
543 aa  90.1  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.84 
 
 
550 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.99 
 
 
580 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 
586 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.97 
 
 
573 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.66 
 
 
568 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.57 
 
 
568 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.15 
 
 
565 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.25 
 
 
596 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  23.25 
 
 
596 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.61 
 
 
554 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.58 
 
 
538 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  24.09 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
554 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  22.67 
 
 
574 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.88 
 
 
599 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  23.25 
 
 
596 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.91 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.14 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.35 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.25 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.78 
 
 
554 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  22.2 
 
 
554 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  23.19 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  23.19 
 
 
551 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  23.39 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  23.39 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  23.39 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.2 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.49 
 
 
592 aa  77  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.85 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  22.86 
 
 
593 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.33 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  28.49 
 
 
558 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.62 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.44 
 
 
569 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  23.08 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.12 
 
 
592 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.78 
 
 
557 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.69 
 
 
562 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.78 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.17 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>