More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1963 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 320 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  72.03 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  57.28 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  57.28 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  55.06 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  55.52 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.42 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  54.29 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  44.55 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  45.02 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  47.59 
 
 		 314 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  38.49 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  37.38 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  35.4 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  35.74 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  29.72 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  27.54 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  29.04 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  29.51 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.65 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.11 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.78 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.94 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.78 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.46 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.65 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  30.12 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.85 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.74 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.6 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.5 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.04 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.62 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.36 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  29.15 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.84 
 
 		 578 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.17 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  32.49 
 
 		 652 aa  97.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.27 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.37 
 
 		 650 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.82 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  29.58 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.6 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 625 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.43 
 
 		 589 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.93 
 
 		 586 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.89 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.93 
 
 		 584 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  26.22 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.53 
 
 		 622 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.53 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 		 648 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  31.67 
 
 		 565 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.2 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  31.67 
 
 		 565 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.04 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  30.08 
 
 		 579 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  34.88 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  31.31 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.88 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  34.48 
 
 		 614 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.14 
 
 		 595 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.74 
 
 		 550 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.64 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  34.2 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.22 
 
 		 641 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 610 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.29 
 
 		 647 aa  89.7  6e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.8 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.2 
 
 		 391 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.96 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.6 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.49 
 
 		 613 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.16 
 
 		 730 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.96 
 
 		 382 aa  89.4  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.57 
 
 		 737 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.05 
 
 		 363 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.57 
 
 		 538 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.57 
 
 		 561 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  30.65 
 
 		 650 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.71 
 
 		 496 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 562 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.39 
 
 		 570 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>