More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0873 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  100 
 
 
396 aa  806  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
823 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
446 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
443 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  37.71 
 
 
614 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  37.5 
 
 
1074 aa  154  3e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
405 aa  154  3e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
926 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
913 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  34.03 
 
 
508 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.78 
 
 
853 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
456 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
829 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1145 aa  148  1e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
371 aa  148  2e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.44 
 
 
565 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  37.34 
 
 
1046 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  38.11 
 
 
1196 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
791 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
405 aa  147  4e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
785 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
404 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1141 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1143 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
875 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
974 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1240 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  26.1 
 
 
406 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
1161 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.44 
 
 
1346 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
601 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
780 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1203 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
878 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
962 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
909 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
912 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
975 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1356 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
667 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  34.94 
 
 
550 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
646 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
957 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.64 
 
 
918 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.39 
 
 
918 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  34.5 
 
 
594 aa  142  1e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.39 
 
 
918 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
970 aa  142  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.93 
 
 
918 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  31.21 
 
 
998 aa  142  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.39 
 
 
918 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.93 
 
 
918 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
765 aa  142  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  25.19 
 
 
409 aa  142  1e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
705 aa  141  2e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  35.32 
 
 
1172 aa  141  2e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
568 aa  141  2e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
763 aa  142  2e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
846 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.32 
 
 
968 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.19 
 
 
1442 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1163 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
968 aa  140  4e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.79 
 
 
823 aa  140  4e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  33.78 
 
 
576 aa  140  4e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
469 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
919 aa  140  4e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1160 aa  140  4e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  32.55 
 
 
464 aa  140  4e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1767 aa  140  5e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  35.34 
 
 
857 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1767 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
939 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.78 
 
 
906 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.92 
 
 
1170 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
437 aa  139  9e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1127 aa  139  9e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
919 aa  139  9e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
917 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  5.92891e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 
1153 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  37.55 
 
 
554 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34752e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
906 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
918 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  34.78 
 
 
925 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
639 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
927 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
833 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
947 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
641 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  27.44 
 
 
405 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1099 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.78 
 
 
925 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>