More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2319 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 124 aa  243  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  40.98 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  32.53 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 491 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  40 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  42 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  42 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 169 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  40 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  40 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.48 
 
 		 245 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 244 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  33.33 
 
 		 377 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  34.92 
 
 		 342 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 348 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>