77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2052 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  77.26 
 
 		 372 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  78.74 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  77.08 
 
 		 367 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  80.23 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  72.99 
 
 		 357 aa  532  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.36 
 
 		 370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  36.18 
 
 		 342 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  36.62 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  36.78 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  34.73 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  36.18 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  37.24 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  36.99 
 
 		 353 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  37.33 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.54 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  34.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  34.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  34.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.29 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  35.57 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  35.69 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  37.96 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  35.69 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  35.4 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  35.4 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  36.56 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  35.48 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  36.57 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  34.6 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  36.34 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  34.22 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  35.69 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  33.9 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  33.43 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  33.43 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  34.48 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  34.68 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  32.19 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.97 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  31.34 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.05 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  34.01 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 334 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  32.56 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 361 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  30.6 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  32.28 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  31.49 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  31.99 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  33.04 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  31.99 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  35.64 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  29.77 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  32.64 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  30.17 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  30.56 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 181 aa  47.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 134 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  27.1 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  30.61 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  30.97 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  30.08 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  29.13 
 
 		 358 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  29.13 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>