More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0373 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  100 
 
 		 451 aa  898    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  45.26 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  42.82 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  42.99 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  40.28 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  42.96 
 
 		 446 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  40.74 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  42.25 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  41.82 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  40.95 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  41.23 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  42.76 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  41.78 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  41.78 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  39.62 
 
 		 426 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  41.11 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  42.41 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.67 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  41.67 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  41.43 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  38 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  39.81 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  38.48 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  38 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  38.48 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  39.67 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  36.99 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  36.89 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  38.66 
 
 		 446 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  40.05 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  37.3 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  39.43 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  39.19 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  34.82 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  34.04 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  36.89 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  36.07 
 
 		 431 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.82 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  36.58 
 
 		 435 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.93 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  37.57 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.54 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.89 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.54 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  33.49 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  33.49 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  34.12 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  31.47 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  33.25 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.99 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  34.81 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  31.46 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.64 
 
 		 481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  31.97 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.24 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.64 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.46 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.56 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  34.52 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.98 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  31.25 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.98 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.52 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.45 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  32.8 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.13 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.86 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.9 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.67 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.67 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.67 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  32.21 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.63 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  30.55 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  31.88 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  34.38 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  30.46 
 
 		 551 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.88 
 
 		 434 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  27.68 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.16 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  33.07 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.74 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  30.88 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  33.25 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  33.25 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  31.85 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  33.25 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>