58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1686 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  100 
 
 		 780 aa  1619    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  41.04 
 
 		 799 aa  581  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  43.28 
 
 		 612 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  41.82 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  43.11 
 
 		 612 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  41.76 
 
 		 610 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  42.18 
 
 		 586 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  39.97 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  40.24 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  37.33 
 
 		 625 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  37.95 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  36.65 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  38.45 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  39.52 
 
 		 643 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  37.56 
 
 		 586 aa  376  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  38.94 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  35.68 
 
 		 632 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  36 
 
 		 598 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  35.53 
 
 		 631 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  33.96 
 
 		 898 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  35.94 
 
 		 924 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.95 
 
 		 1392 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  33.88 
 
 		 892 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  30.66 
 
 		 996 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  30.5 
 
 		 985 aa  134  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  36.76 
 
 		 832 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  41.1 
 
 		 801 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  26.85 
 
 		 827 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  36.76 
 
 		 796 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  34.09 
 
 		 808 aa  107  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  33.53 
 
 		 739 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  35.33 
 
 		 802 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  24.72 
 
 		 951 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  33.14 
 
 		 837 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  27.66 
 
 		 672 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  46.59 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  26.79 
 
 		 682 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.33 
 
 		 600 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  40.23 
 
 		 1264 aa  69.7  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  40.79 
 
 		 1001 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  41.33 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.25 
 
 		 1289 aa  61.6  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.78 
 
 		 1471 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  27.65 
 
 		 569 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  29.52 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.62 
 
 		 1329 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.57 
 
 		 687 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  32.41 
 
 		 2095 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  32.11 
 
 		 2095 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  26.09 
 
 		 546 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  24.39 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  26.63 
 
 		 534 aa  51.6  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  34.94 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  36.11 
 
 		 713 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  36.23 
 
 		 1173 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.99 
 
 		 850 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.57 
 
 		 704 aa  44.3  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  23.91 
 
 		 466 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>