52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01626 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  69.82 
 
 		 612 aa  888    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  100 
 
 		 613 aa  1253    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  69.38 
 
 		 612 aa  884    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  41.5 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  41.82 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  43.4 
 
 		 799 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  40.17 
 
 		 586 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  44.09 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  42.41 
 
 		 625 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  43.38 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  40.66 
 
 		 586 aa  405  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  38.19 
 
 		 632 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.74 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  39.29 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  38.62 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  39.68 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  38.95 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  39.44 
 
 		 580 aa  346  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  35.76 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  38.48 
 
 		 898 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  36.94 
 
 		 924 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  31.39 
 
 		 892 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  43.84 
 
 		 801 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  43.15 
 
 		 832 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  39.64 
 
 		 827 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.08 
 
 		 1392 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  28.94 
 
 		 985 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  29.17 
 
 		 996 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  32.11 
 
 		 796 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  36.36 
 
 		 808 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  36.24 
 
 		 802 aa  97.4  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  36.9 
 
 		 837 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  29.39 
 
 		 672 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  27.27 
 
 		 951 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  32 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  28.49 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  30.3 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  22 
 
 		 609 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  31.71 
 
 		 534 aa  50.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  26.17 
 
 		 672 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  29.05 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  28.34 
 
 		 534 aa  47.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  26.46 
 
 		 466 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  28.12 
 
 		 711 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 711 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  27.86 
 
 		 569 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  25.51 
 
 		 925 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  22.7 
 
 		 669 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  26.45 
 
 		 646 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  26.47 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  42.25 
 
 		 571 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  25.32 
 
 		 683 aa  43.5  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>