40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2576 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  100 
 
 		 579 aa  1172    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  64.73 
 
 		 586 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  57.99 
 
 		 586 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  54.75 
 
 		 584 aa  611  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  51.97 
 
 		 584 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  47.72 
 
 		 576 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  47.21 
 
 		 625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  47.43 
 
 		 580 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  41.9 
 
 		 631 aa  428  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.1 
 
 		 598 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  38.42 
 
 		 780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  40.14 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.73 
 
 		 612 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  41.35 
 
 		 612 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  38.74 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  40 
 
 		 799 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  36.97 
 
 		 586 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  35.36 
 
 		 632 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  35.26 
 
 		 643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  41.96 
 
 		 898 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.49 
 
 		 1392 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  34.29 
 
 		 924 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  33.98 
 
 		 892 aa  143  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  32.01 
 
 		 996 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  30.45 
 
 		 801 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  27.58 
 
 		 985 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  26.42 
 
 		 827 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  38.07 
 
 		 739 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  38.6 
 
 		 808 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  38.55 
 
 		 837 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  34.38 
 
 		 796 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  32.37 
 
 		 672 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  37.29 
 
 		 832 aa  95.5  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  35.43 
 
 		 802 aa  90.9  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  31.15 
 
 		 682 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  23.77 
 
 		 951 aa  74.3  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  34.88 
 
 		 644 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  27.43 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  27.22 
 
 		 571 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 554 aa  43.5  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>