41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5411 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  100 
 
 		 586 aa  1216    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  48.21 
 
 		 632 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  49.14 
 
 		 643 aa  553  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  44.48 
 
 		 610 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.61 
 
 		 612 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  41.04 
 
 		 799 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  40.58 
 
 		 612 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  40.44 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  42.69 
 
 		 780 aa  461  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  38.22 
 
 		 584 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  36.61 
 
 		 586 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.6 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  38.04 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  37.26 
 
 		 584 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  36.61 
 
 		 576 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  35.56 
 
 		 625 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  36.44 
 
 		 579 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  37.85 
 
 		 580 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  32.78 
 
 		 631 aa  309  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  35.6 
 
 		 898 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  30.19 
 
 		 924 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  30.45 
 
 		 996 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  26.35 
 
 		 801 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  26.83 
 
 		 827 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  28.99 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  30.71 
 
 		 1392 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  29.51 
 
 		 985 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 796 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  29.1 
 
 		 832 aa  111  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  34.1 
 
 		 808 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  29.59 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  28.34 
 
 		 802 aa  99.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  25.39 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  27.12 
 
 		 837 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  25.7 
 
 		 951 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  22.91 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  29.25 
 
 		 644 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  24.32 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  25.14 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  24.72 
 
 		 466 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  23.68 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>