15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1291 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 554 aa  1133    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  52.9 
 
 		 569 aa  596  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  35.98 
 
 		 925 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  35.18 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  36.92 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  35.09 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  33.83 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  33.46 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  26.86 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 898 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  29.52 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  25.11 
 
 		 612 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  24.43 
 
 		 579 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  26.29 
 
 		 711 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>