45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1933 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  100 
 
 		 612 aa  1252    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  69.82 
 
 		 613 aa  888    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  98.04 
 
 		 612 aa  1228    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  42.55 
 
 		 610 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  43.11 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  40.58 
 
 		 586 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  43.58 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  40.07 
 
 		 799 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  42.29 
 
 		 625 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  38.28 
 
 		 632 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  41.12 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  40.87 
 
 		 576 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.37 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  39.04 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  41.3 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  36.81 
 
 		 643 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  38.4 
 
 		 586 aa  343  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  37.89 
 
 		 580 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  35.6 
 
 		 631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  39.94 
 
 		 898 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  29.82 
 
 		 924 aa  151  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  30.7 
 
 		 892 aa  131  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  44.52 
 
 		 801 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  30.79 
 
 		 1392 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  40.24 
 
 		 832 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  30.32 
 
 		 985 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  41.5 
 
 		 827 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  41.38 
 
 		 796 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  37.21 
 
 		 808 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  35.94 
 
 		 802 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  34.55 
 
 		 837 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  27.52 
 
 		 996 aa  94  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  29.12 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  26.72 
 
 		 951 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  30.86 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  33.65 
 
 		 644 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  26.74 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  25.31 
 
 		 609 aa  50.8  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  29.51 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  31.33 
 
 		 534 aa  48.5  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  24.11 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  24.39 
 
 		 644 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  25.13 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  30.32 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  24.54 
 
 		 672 aa  43.9  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>