37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7453 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  100 
 
 
576 aa  1152    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  54.91 
 
 
580 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  49.51 
 
 
625 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  50.08 
 
 
584 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  46.5 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  47.17 
 
 
586 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  47.82 
 
 
586 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  46.3 
 
 
584 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  47.55 
 
 
579 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  43.38 
 
 
613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  40.24 
 
 
780 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  38.85 
 
 
610 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  36.18 
 
 
598 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.87 
 
 
612 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  40.86 
 
 
799 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  40.87 
 
 
612 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  36.61 
 
 
586 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  35.26 
 
 
632 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  36.54 
 
 
643 aa  303  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  42.33 
 
 
898 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  43.13 
 
 
924 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.71 
 
 
1392 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  31.8 
 
 
892 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  30 
 
 
985 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  30.62 
 
 
801 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  38.6 
 
 
808 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  28 
 
 
827 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  39.44 
 
 
832 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  34.66 
 
 
739 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  30 
 
 
996 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  28.09 
 
 
802 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  36.72 
 
 
837 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  31.69 
 
 
796 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  30.6 
 
 
672 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  40.59 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  28.32 
 
 
951 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  25.79 
 
 
682 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>