45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0079 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  100 
 
 
739 aa  1523    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  31.87 
 
 
808 aa  335  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  29.08 
 
 
837 aa  265  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  40 
 
 
898 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  38.54 
 
 
625 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  38.07 
 
 
579 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  36.42 
 
 
1392 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  40 
 
 
631 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  36.42 
 
 
586 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  34.66 
 
 
586 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  34.66 
 
 
576 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  33.53 
 
 
780 aa  107  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  34.09 
 
 
584 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  34.86 
 
 
924 aa  105  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  24.33 
 
 
682 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  29.59 
 
 
586 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  33.71 
 
 
799 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  23.54 
 
 
996 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  27.16 
 
 
672 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  32.96 
 
 
598 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  25.52 
 
 
801 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
580 aa  96.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  30.27 
 
 
610 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  36.36 
 
 
584 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  32.37 
 
 
827 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  32.05 
 
 
892 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  29.19 
 
 
632 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  32 
 
 
613 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  31.36 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  30.86 
 
 
612 aa  79  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  30.29 
 
 
612 aa  79  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  32.08 
 
 
832 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  27.91 
 
 
985 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  32.73 
 
 
796 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  31.25 
 
 
802 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  29.31 
 
 
951 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  29.09 
 
 
644 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  29 
 
 
661 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  29 
 
 
664 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  29 
 
 
664 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  29 
 
 
664 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  28 
 
 
663 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  23.08 
 
 
715 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  23.88 
 
 
691 aa  46.2  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  28 
 
 
663 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>