38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  100 
 
 		 586 aa  1173    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  56.51 
 
 		 584 aa  635    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  64.38 
 
 		 579 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  58.7 
 
 		 586 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  51.83 
 
 		 584 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  47.82 
 
 		 576 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  46.8 
 
 		 625 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  46.13 
 
 		 580 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.36 
 
 		 598 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  41.76 
 
 		 631 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  40.66 
 
 		 613 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  41.14 
 
 		 799 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  41.12 
 
 		 612 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  36.65 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.7 
 
 		 612 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  38.15 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  37.24 
 
 		 632 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  36.61 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  35.79 
 
 		 643 aa  316  8e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  40.06 
 
 		 898 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.25 
 
 		 1392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  34.42 
 
 		 892 aa  140  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  30.17 
 
 		 924 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  32.11 
 
 		 996 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  26.71 
 
 		 985 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  27.08 
 
 		 801 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  36.42 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  39.67 
 
 		 802 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  34.29 
 
 		 808 aa  107  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  36.63 
 
 		 832 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  32.26 
 
 		 796 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  24.38 
 
 		 827 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  29.95 
 
 		 672 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  34.66 
 
 		 837 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  28.65 
 
 		 951 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  34.82 
 
 		 682 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  33.91 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  25.12 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>