38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1050 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  100 
 
 
580 aa  1181    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  55.48 
 
 
576 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  50.35 
 
 
625 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  48.32 
 
 
584 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  46.42 
 
 
586 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  47.43 
 
 
579 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  44.75 
 
 
631 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  44.62 
 
 
586 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  44.34 
 
 
584 aa  425  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  37.82 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  40.71 
 
 
799 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  39.18 
 
 
780 aa  382  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  40.21 
 
 
613 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  37.39 
 
 
610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  38.1 
 
 
586 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  38.06 
 
 
612 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  37.72 
 
 
612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  34.12 
 
 
632 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  35.23 
 
 
643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  38.05 
 
 
898 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  33.44 
 
 
924 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  32.49 
 
 
892 aa  147  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.68 
 
 
1392 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  27.73 
 
 
985 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  29.45 
 
 
827 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  30.3 
 
 
996 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  28.19 
 
 
801 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  37.1 
 
 
796 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  37.89 
 
 
837 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  33.33 
 
 
739 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  36.2 
 
 
808 aa  94.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  36.42 
 
 
832 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  35.06 
 
 
802 aa  87.4  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  32.94 
 
 
672 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  29.3 
 
 
951 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  36.43 
 
 
644 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  36.73 
 
 
682 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  25.95 
 
 
569 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>