42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4556 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  100 
 
 		 610 aa  1263    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  44.37 
 
 		 799 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  41.5 
 
 		 613 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  42.38 
 
 		 612 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  42.55 
 
 		 612 aa  492  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  41.76 
 
 		 780 aa  481  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  44.48 
 
 		 586 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  39.5 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  38.85 
 
 		 576 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  38.15 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  35.77 
 
 		 632 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  38.22 
 
 		 584 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  36.58 
 
 		 625 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  38.45 
 
 		 643 aa  363  5.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  38.86 
 
 		 586 aa  362  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  38.64 
 
 		 579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  36.12 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  36.68 
 
 		 580 aa  340  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  34.7 
 
 		 631 aa  310  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  35.65 
 
 		 898 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  36.41 
 
 		 924 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  27.85 
 
 		 801 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  38.51 
 
 		 832 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  30.13 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  28.02 
 
 		 1392 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  35.8 
 
 		 808 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  32.24 
 
 		 796 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  28.24 
 
 		 996 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  36.22 
 
 		 827 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  26.52 
 
 		 985 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  33.69 
 
 		 802 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  30.27 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  29.51 
 
 		 672 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  31.11 
 
 		 837 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  27.75 
 
 		 951 aa  81.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  23.94 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  28.91 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  23.78 
 
 		 569 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  24.23 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  26.17 
 
 		 672 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  20.73 
 
 		 534 aa  43.9  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>