38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3250 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  100 
 
 		 796 aa  1596    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  44.02 
 
 		 802 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  39.79 
 
 		 832 aa  429  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  34.35 
 
 		 827 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  31.49 
 
 		 801 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  32.24 
 
 		 610 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  41.38 
 
 		 612 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.69 
 
 		 612 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  25.81 
 
 		 586 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  36.76 
 
 		 780 aa  110  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  34.88 
 
 		 924 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  28.12 
 
 		 625 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 799 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  25.22 
 
 		 892 aa  107  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  36.32 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  32.11 
 
 		 613 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  40.28 
 
 		 631 aa  104  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  35.45 
 
 		 898 aa  103  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  33.91 
 
 		 1392 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  37.1 
 
 		 580 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  31.91 
 
 		 584 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  34.76 
 
 		 808 aa  97.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  34.38 
 
 		 579 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  32.02 
 
 		 632 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  32.64 
 
 		 598 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  32.26 
 
 		 586 aa  93.6  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  31.69 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  30.52 
 
 		 643 aa  89.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  36.61 
 
 		 584 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  34.81 
 
 		 837 aa  87.8  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  29.61 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  29.27 
 
 		 985 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  28.5 
 
 		 996 aa  78.2  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  32.73 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  30.73 
 
 		 682 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  26.19 
 
 		 951 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  38.82 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 685 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>