15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1339 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1154    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  46.67 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  37.93 
 
 		 925 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  40.91 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  37.87 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  35.2 
 
 		 546 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  35.15 
 
 		 534 aa  263  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  33.69 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  39.11 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  30.97 
 
 		 612 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  30.73 
 
 		 612 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  25.11 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  27.22 
 
 		 579 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  42.25 
 
 		 613 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  29.08 
 
 		 714 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>