19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2959 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  100 
 
 		 571 aa  1154    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  47.55 
 
 		 925 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  46.57 
 
 		 571 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  47.3 
 
 		 534 aa  438  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  35.45 
 
 		 569 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  33.9 
 
 		 546 aa  263  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  43.03 
 
 		 534 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  37.4 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  29.05 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  22.94 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  31.18 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  26.19 
 
 		 690 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.38 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  17.54 
 
 		 683 aa  44.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  26.74 
 
 		 700 aa  44.3  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  24.26 
 
 		 669 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 645 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  27.49 
 
 		 685 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>