21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2520 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2520  glycoside hydrolase family 35  100 
 
 		 534 aa  1069    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  35.4 
 
 		 925 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  43.03 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  43.33 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1339  hypothetical protein  36.86 
 
 		 571 aa  269  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.946063  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1291  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186796  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3530  glycoside hydrolase family 35  37.26 
 
 		 546 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0694576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2501  DNA recombination protein, RuvA  37.33 
 
 		 569 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00226374  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02804  beta-galactosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00670)  36.67 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409324  normal  0.343793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  31.07 
 
 		 612 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  27.53 
 
 		 579 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  30.51 
 
 		 612 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  27.49 
 
 		 780 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  27.59 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  28.49 
 
 		 613 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  28.57 
 
 		 799 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  21.29 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  24.16 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1596  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  36.51 
 
 		 778 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  27.16 
 
 		 580 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  24.19 
 
 		 632 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>