36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6638 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  100 
 
 
644 aa  1236    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  26.57 
 
 
672 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  34.15 
 
 
898 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  44.32 
 
 
924 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  32.74 
 
 
837 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  35.65 
 
 
586 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  40.59 
 
 
576 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  34.88 
 
 
579 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  35.19 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  37.5 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  31.98 
 
 
625 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  30.77 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  33.65 
 
 
612 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  33.65 
 
 
612 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  31.37 
 
 
808 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  30 
 
 
1392 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  33.91 
 
 
586 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  28.91 
 
 
610 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  31.37 
 
 
598 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  38.1 
 
 
801 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  29.09 
 
 
739 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  37.01 
 
 
580 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  30.3 
 
 
613 aa  60.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  29.52 
 
 
780 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  33.68 
 
 
996 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  29.61 
 
 
643 aa  59.7  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  29.25 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  33.02 
 
 
827 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  30.77 
 
 
892 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  29.92 
 
 
799 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  29.81 
 
 
985 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  27.34 
 
 
632 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  38.82 
 
 
796 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  35.48 
 
 
832 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  26.2 
 
 
682 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  28.39 
 
 
802 aa  45.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>