37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0900 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  100 
 
 
892 aa  1804    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  34.76 
 
 
1392 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  36.39 
 
 
898 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  32.42 
 
 
625 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  33.02 
 
 
598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  34.74 
 
 
584 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  31.86 
 
 
580 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  33.97 
 
 
584 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  31.14 
 
 
799 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  34.42 
 
 
586 aa  140  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  31.83 
 
 
631 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  33.12 
 
 
579 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  33.88 
 
 
780 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  32.46 
 
 
586 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  42.47 
 
 
924 aa  132  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  30.38 
 
 
612 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  30.7 
 
 
612 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  31.39 
 
 
613 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  31.8 
 
 
576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  30.13 
 
 
610 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  29.71 
 
 
801 aa  124  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  28.99 
 
 
586 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  25.87 
 
 
996 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  30.75 
 
 
827 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  26.91 
 
 
985 aa  110  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
796 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  27.44 
 
 
632 aa  104  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  27.97 
 
 
643 aa  100  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  25.56 
 
 
802 aa  98.2  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  23.75 
 
 
832 aa  93.6  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  32.05 
 
 
739 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  33.54 
 
 
808 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  32.7 
 
 
837 aa  77.8  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  27.78 
 
 
672 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  27.33 
 
 
682 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  30.77 
 
 
951 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  30.77 
 
 
644 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>