37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1364 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  100 
 
 		 827 aa  1678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  36.22 
 
 		 832 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  33.83 
 
 		 801 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  34.09 
 
 		 796 aa  361  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  34.59 
 
 		 802 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  28.13 
 
 		 898 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  26.83 
 
 		 586 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  37.93 
 
 		 799 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  39.64 
 
 		 613 aa  124  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  27.82 
 
 		 625 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  26.85 
 
 		 780 aa  119  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  38.69 
 
 		 612 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  41.5 
 
 		 612 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  36.22 
 
 		 610 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  29.04 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  28.05 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  30.75 
 
 		 892 aa  112  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  28.57 
 
 		 1392 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  26.42 
 
 		 579 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  29.44 
 
 		 586 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  28.36 
 
 		 580 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  28 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  28.02 
 
 		 632 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  26.49 
 
 		 584 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 643 aa  97.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  33.33 
 
 		 996 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  25.67 
 
 		 631 aa  93.6  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  33.14 
 
 		 808 aa  92.8  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  32.37 
 
 		 739 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  24.38 
 
 		 586 aa  92.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  25.73 
 
 		 924 aa  92  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  24.01 
 
 		 985 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  34.09 
 
 		 837 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  25.53 
 
 		 951 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  26.2 
 
 		 672 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  30.77 
 
 		 682 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  33.02 
 
 		 644 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>