37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4420 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  100 
 
 		 584 aa  1177    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  52.61 
 
 		 586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  51.83 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  51.79 
 
 		 579 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  50.08 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  50.08 
 
 		 576 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  47.07 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  48.15 
 
 		 580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  44.09 
 
 		 613 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  39.97 
 
 		 780 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  43.58 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  42.24 
 
 		 799 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  43.23 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  40.39 
 
 		 631 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  38.71 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  39.57 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  38.32 
 
 		 632 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  38.74 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  37.35 
 
 		 643 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  42.82 
 
 		 898 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  43.69 
 
 		 924 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  34.74 
 
 		 892 aa  156  9e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.79 
 
 		 1392 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  31.23 
 
 		 985 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  40.78 
 
 		 837 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  30.34 
 
 		 996 aa  124  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  37.5 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  25.78 
 
 		 801 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  32.63 
 
 		 672 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  39.08 
 
 		 832 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  26.49 
 
 		 827 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  36.36 
 
 		 739 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  36.79 
 
 		 802 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  36.61 
 
 		 796 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  35.9 
 
 		 644 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  24.71 
 
 		 951 aa  80.9  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  31.46 
 
 		 682 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>