164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0117 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  100 
 
 		 351 aa  714    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  48.36 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  46.61 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  45.99 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  45.82 
 
 		 350 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  45.45 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  46.59 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  46.33 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  44.67 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  43.2 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  40.52 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  44.02 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  43.6 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  41.37 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  41.31 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  42.44 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  41.94 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  41.64 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  42.15 
 
 		 639 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  43.62 
 
 		 640 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  42.27 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  43.15 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  43.28 
 
 		 624 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  41.16 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  40.41 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  39.31 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  38.94 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  41.16 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  39.07 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  40.18 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  39.19 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  39.65 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  38.89 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  38.81 
 
 		 631 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  40.82 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  39.15 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  37.92 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  37.68 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  35.89 
 
 		 364 aa  222  6e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  38.12 
 
 		 340 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  39.89 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  35.82 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  37.54 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.12 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.12 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  37.28 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  38.24 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  38.24 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  38.24 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  36.84 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.61 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  37.18 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  36.41 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  37.11 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  38.74 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  36.62 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  37.18 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  37.18 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  37.11 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  37.46 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  36.49 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  36.62 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  36.24 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.64 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  36.49 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  34.19 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  37.61 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  37.61 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  34.1 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  38.94 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.14 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  36.07 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.65 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  37.05 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  37.05 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  39.65 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  35.48 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  36.77 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.93 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.93 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.11 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  37.4 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  35.48 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  36.83 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  37.25 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.31 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  34.34 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.85 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  36.63 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>