More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1924 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  50.68 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  50.23 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  52.07 
 
 		 217 aa  204  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  52.48 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  51.15 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  49.77 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  50.92 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  48 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  47.98 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  47.56 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  48.86 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  47.71 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  48.39 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  47.93 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  45.25 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  47.95 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  47.93 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  48.02 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  46.64 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  46.61 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  46.61 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  46.61 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  45.16 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  44.09 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  47.76 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  45.54 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  43.67 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  44.34 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  41.4 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  38.77 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  38.33 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  42.34 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  42.98 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  44.02 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  45.09 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  42.27 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  37.61 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.03 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.65 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  35.87 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.59 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.41 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  33 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  36.45 
 
 		 465 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  34.51 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  37.9 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  32.27 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.36 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 		 450 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  35.1 
 
 		 458 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  33.01 
 
 		 445 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 		 459 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.05 
 
 		 457 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 448 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 		 448 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  32.6 
 
 		 445 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.6 
 
 		 458 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  30.95 
 
 		 458 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.96 
 
 		 449 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  34.26 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  34.26 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  34.26 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31.25 
 
 		 457 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  32.38 
 
 		 458 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  33.65 
 
 		 458 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  31.17 
 
 		 444 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  35.78 
 
 		 445 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 		 458 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  34.56 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  34.1 
 
 		 458 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 445 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 		 467 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  34.13 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  31.65 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 444 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 450 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>