103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3599 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 778 aa  1512    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  93.78 
 
 		 778 aa  1333    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  93.65 
 
 		 778 aa  1354    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.07 
 
 		 734 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  31.76 
 
 		 754 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  28.12 
 
 		 834 aa  258  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.05 
 
 		 778 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  27.22 
 
 		 788 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.12 
 
 		 798 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  26.46 
 
 		 765 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.2 
 
 		 794 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.64 
 
 		 775 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  28 
 
 		 810 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  27.51 
 
 		 766 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  27.94 
 
 		 803 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.61 
 
 		 785 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  31.2 
 
 		 783 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 781 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  27.64 
 
 		 842 aa  158  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  27.83 
 
 		 803 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  27.83 
 
 		 782 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  27.49 
 
 		 803 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.08 
 
 		 797 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.79 
 
 		 834 aa  153  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.84 
 
 		 765 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.69 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  26.9 
 
 		 790 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.12 
 
 		 849 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.83 
 
 		 794 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.63 
 
 		 808 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  26.69 
 
 		 790 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  28.65 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.42 
 
 		 816 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.28 
 
 		 748 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.06 
 
 		 782 aa  144  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.89 
 
 		 791 aa  141  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.86 
 
 		 786 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.1 
 
 		 788 aa  128  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  25.27 
 
 		 804 aa  126  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.55 
 
 		 790 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.95 
 
 		 789 aa  124  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  25.96 
 
 		 840 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  31.43 
 
 		 766 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  31.43 
 
 		 766 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  32.11 
 
 		 814 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.11 
 
 		 807 aa  100  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  31.43 
 
 		 766 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  31.07 
 
 		 803 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  31.43 
 
 		 766 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  31.17 
 
 		 766 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  31.17 
 
 		 984 aa  98.2  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  29.73 
 
 		 815 aa  95.5  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.73 
 
 		 815 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  29.73 
 
 		 815 aa  95.1  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03367  P pilus assembly protein, porin PapC  27.9 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  22.48 
 
 		 914 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  22.48 
 
 		 913 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3335  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.27 
 
 		 804 aa  67.4  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322064  normal  0.349382 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  22.3 
 
 		 914 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  21.52 
 
 		 939 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4579  CshB porin  23.93 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.363192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.8 
 
 		 930 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  22.56 
 
 		 839 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  24.62 
 
 		 883 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.51 
 
 		 963 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  24.62 
 
 		 875 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.62 
 
 		 883 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.55 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.9 
 
 		 833 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.16 
 
 		 884 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.88 
 
 		 851 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.84 
 
 		 831 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  24.95 
 
 		 872 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.98 
 
 		 837 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  30.34 
 
 		 833 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  30.34 
 
 		 833 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.93 
 
 		 836 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  30.34 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.21 
 
 		 837 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.89 
 
 		 851 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.37 
 
 		 880 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  29.46 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  29.46 
 
 		 836 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.32 
 
 		 840 aa  46.6  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  25.38 
 
 		 901 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 		 826 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  24.74 
 
 		 837 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.4 
 
 		 830 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.4 
 
 		 830 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  26.92 
 
 		 826 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 		 826 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  25.89 
 
 		 842 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  26.92 
 
 		 826 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  24 
 
 		 840 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.87 
 
 		 901 aa  45.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  28.68 
 
 		 836 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 		 818 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.6 
 
 		 866 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  27.55 
 
 		 823 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  27.55 
 
 		 823 aa  44.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>