72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0764 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1682    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3335  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.74 
 
 		 804 aa  301  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322064  normal  0.349382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03367  P pilus assembly protein, porin PapC  27.39 
 
 		 796 aa  196  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.57 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  23.18 
 
 		 834 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.48 
 
 		 778 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.98 
 
 		 778 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.08 
 
 		 778 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  27.22 
 
 		 754 aa  90.5  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  24.78 
 
 		 790 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  24.78 
 
 		 790 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.63 
 
 		 797 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.82 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.04 
 
 		 791 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.19 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.27 
 
 		 765 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.93 
 
 		 781 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  29.17 
 
 		 782 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  29.17 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  29.17 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  29.17 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  29.17 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.1 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  23.94 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.73 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  25.37 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.22 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.17 
 
 		 794 aa  71.2  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.12 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.3 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.31 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  29.31 
 
 		 814 aa  68.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.32 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.14 
 
 		 786 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  23.57 
 
 		 842 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.32 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.68 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.17 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  24.17 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  22.44 
 
 		 766 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  22.44 
 
 		 766 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  22.44 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  22.26 
 
 		 984 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  23.7 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  22.26 
 
 		 766 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  22.26 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  22.26 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  23.23 
 
 		 786 aa  56.2  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.26 
 
 		 834 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.95 
 
 		 930 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  26.09 
 
 		 783 aa  54.3  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.86 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  23.71 
 
 		 804 aa  51.6  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  27.98 
 
 		 875 aa  50.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  27.98 
 
 		 883 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.98 
 
 		 883 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  22.38 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.76 
 
 		 866 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 929 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  22.52 
 
 		 913 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.85 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.28 
 
 		 887 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  22.38 
 
 		 914 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  22.52 
 
 		 914 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.85 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  26.06 
 
 		 854 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.06 
 
 		 863 aa  45.8  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  26.06 
 
 		 854 aa  45.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  27.14 
 
 		 872 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.12 
 
 		 890 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  21.74 
 
 		 939 aa  44.3  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  21.12 
 
 		 833 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>