More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0803 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  97.43 
 
 
350 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  97.43 
 
 
350 aa  709    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
350 aa  723    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  78.57 
 
 
351 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  47.59 
 
 
389 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  42.68 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  43.21 
 
 
316 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  38.21 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  38.94 
 
 
342 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.19 
 
 
311 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  36.83 
 
 
302 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  37.92 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  34.24 
 
 
330 aa  219  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  38.79 
 
 
313 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.64 
 
 
362 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  35.93 
 
 
362 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  36.04 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  34.02 
 
 
329 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  36.31 
 
 
301 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  36.39 
 
 
310 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 
337 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 
337 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.81 
 
 
359 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  36.7 
 
 
337 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 
321 aa  202  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  34.98 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.45 
 
 
316 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  39.26 
 
 
405 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
288 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
318 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  32.41 
 
 
408 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 
358 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  36.03 
 
 
426 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  34.73 
 
 
318 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.87 
 
 
382 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.87 
 
 
382 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  31.04 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  32.12 
 
 
384 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 
382 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 
382 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  31.84 
 
 
394 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.36 
 
 
384 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.28 
 
 
391 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.23 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.7 
 
 
211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 
329 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30.6 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  34.6 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 
351 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 
352 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  33.05 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.14 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  45.3 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.06 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  33.05 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.8 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
367 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  37.01 
 
 
271 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  23.68 
 
 
544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  34.76 
 
 
330 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
381 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 
354 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.74 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  25.45 
 
 
524 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  31.2 
 
 
372 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 
378 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  32.8 
 
 
322 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  28.06 
 
 
352 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  29.36 
 
 
343 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 
279 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.99 
 
 
401 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 
377 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  24.26 
 
 
557 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.41 
 
 
342 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 
532 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.84 
 
 
377 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
303 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  24.82 
 
 
538 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
338 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 
389 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 
275 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 
269 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 
326 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 
255 aa  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 
374 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  25.37 
 
 
535 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.62 
 
 
366 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  25.37 
 
 
535 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  28.63 
 
 
308 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.86 
 
 
272 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  24.63 
 
 
532 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.08 
 
 
371 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>