More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0395 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 709 aa  1439    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  51.95 
 
 		 761 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  48.75 
 
 		 727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  50 
 
 		 765 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  46.41 
 
 		 727 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  44.57 
 
 		 828 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  43.4 
 
 		 905 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  40.16 
 
 		 795 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  43.36 
 
 		 806 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  39.54 
 
 		 679 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  39.87 
 
 		 680 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  41.59 
 
 		 680 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  41.42 
 
 		 680 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  41.42 
 
 		 667 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  41.42 
 
 		 680 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  41.77 
 
 		 680 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 679 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  41.24 
 
 		 673 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  41.24 
 
 		 680 aa  429  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  41.24 
 
 		 673 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 941 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  41.16 
 
 		 912 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  42.08 
 
 		 880 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  40.81 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  42.96 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  41.4 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.7 
 
 		 776 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  41.52 
 
 		 751 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  39.01 
 
 		 705 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  43.06 
 
 		 761 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 		 901 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  40.59 
 
 		 746 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  40.59 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  40.41 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  37.78 
 
 		 814 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  40.3 
 
 		 705 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  40.3 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  40.59 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  37.36 
 
 		 843 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  39.85 
 
 		 746 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  40.22 
 
 		 705 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  38.83 
 
 		 705 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.19 
 
 		 685 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.42 
 
 		 648 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  40.53 
 
 		 734 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  36.86 
 
 		 846 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  36.86 
 
 		 820 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  39.56 
 
 		 836 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  39.12 
 
 		 832 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  39.12 
 
 		 830 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 		 755 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 811 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  36.71 
 
 		 834 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  42.12 
 
 		 714 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  41.5 
 
 		 732 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  40.45 
 
 		 728 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  38.37 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 		 646 aa  366  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  38.98 
 
 		 834 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  41.24 
 
 		 734 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.23 
 
 		 658 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 721 aa  364  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 676 aa  364  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  36.2 
 
 		 835 aa  363  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  37.42 
 
 		 794 aa  363  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.68 
 
 		 640 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 837 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 		 770 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 829 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  41.91 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  40.79 
 
 		 654 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  41.72 
 
 		 727 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.38 
 
 		 643 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.38 
 
 		 643 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  41.75 
 
 		 714 aa  360  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.42 
 
 		 727 aa  360  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  38.75 
 
 		 837 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  40.98 
 
 		 735 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  39.73 
 
 		 739 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.8 
 
 		 741 aa  356  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  36.14 
 
 		 708 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 833 aa  353  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 730 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 763 aa  353  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  39.73 
 
 		 651 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 640 aa  351  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  38.69 
 
 		 720 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  40.99 
 
 		 757 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 712 aa  349  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 667 aa  349  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 680 aa  348  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  39.59 
 
 		 625 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  41.75 
 
 		 775 aa  348  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>