More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0057 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0057  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 413 aa  845    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  28.51 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  28.51 
 
 		 594 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  28.51 
 
 		 594 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  28.11 
 
 		 594 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  28.8 
 
 		 613 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  27.31 
 
 		 594 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  28.67 
 
 		 653 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  25.81 
 
 		 641 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  27.42 
 
 		 607 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  25.88 
 
 		 609 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  25.63 
 
 		 688 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  26.67 
 
 		 653 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  22.09 
 
 		 625 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  27.5 
 
 		 628 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  24.71 
 
 		 613 aa  86.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  25.9 
 
 		 626 aa  86.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  24.08 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  25.81 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  27.11 
 
 		 649 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  24.91 
 
 		 700 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  30.08 
 
 		 780 aa  84  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  25.9 
 
 		 598 aa  83.2  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  25.09 
 
 		 687 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  26.67 
 
 		 607 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  26.21 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  24.87 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  24.91 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  27.06 
 
 		 779 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  24.91 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  27.01 
 
 		 762 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  27.37 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  25.2 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  26.71 
 
 		 610 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  26.39 
 
 		 608 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  21.41 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  25.44 
 
 		 631 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  28.01 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  27.14 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  23.89 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  26.52 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  25.97 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  24.1 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  27.88 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  25.6 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  25.15 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  25.55 
 
 		 636 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  25.54 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  25.27 
 
 		 601 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  26.39 
 
 		 608 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  25.81 
 
 		 679 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  24.54 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  25.89 
 
 		 692 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  29.44 
 
 		 746 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  25.33 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  25.47 
 
 		 634 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2319  Excinuclease ABC C subunit domain protein  25.35 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  22.89 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  25.52 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  25.18 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  24.8 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  25 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  24.35 
 
 		 610 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  25.28 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  24.81 
 
 		 613 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  21.24 
 
 		 593 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  24.69 
 
 		 613 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  21.24 
 
 		 593 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  26.41 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  24.35 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  27.8 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  24.05 
 
 		 610 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  24.35 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  24.34 
 
 		 624 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  27.82 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  24.35 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  24.35 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  24.35 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  28.41 
 
 		 601 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  23.83 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  24.91 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  25.19 
 
 		 668 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  24.9 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  25.37 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  24.26 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  22.76 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  23.61 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  24.45 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  26 
 
 		 612 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  25.93 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  22.88 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  24.9 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  23.53 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  25 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>