More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0110 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 148 aa  302  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  77.1 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  71.85 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  74.81 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  73.97 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  74.62 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  72.99 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  68.06 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  67.79 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  76.67 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  72.54 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  69.7 
 
 		 143 aa  196  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  75.63 
 
 		 153 aa  193  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  75.42 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  74.78 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  65.65 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 148 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  67.65 
 
 		 145 aa  179  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  67.74 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  62.02 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  64.49 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  63.06 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  50.43 
 
 		 157 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.08 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  46.28 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  46.34 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  44.53 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  44.6 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  46.56 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  44.35 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 299 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 309 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  38.05 
 
 		 287 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 293 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 301 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  38 
 
 		 301 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 255 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 315 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.55 
 
 		 250 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 297 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.65 
 
 		 324 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 305 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 291 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 305 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>