More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0570 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 606 aa  1249    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.34 
 
 		 649 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.49 
 
 		 649 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.5 
 
 		 652 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.43 
 
 		 649 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.46 
 
 		 649 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.09 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  43.47 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  43.55 
 
 		 491 aa  357  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.59 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  46.84 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.24 
 
 		 490 aa  352  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.15 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.2 
 
 		 476 aa  345  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.53 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.08 
 
 		 482 aa  331  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  41.53 
 
 		 489 aa  331  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  40.96 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 		 484 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  38.14 
 
 		 543 aa  290  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.18 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.46 
 
 		 522 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.57 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.87 
 
 		 494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.3 
 
 		 495 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.96 
 
 		 498 aa  238  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.48 
 
 		 495 aa  233  9e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  33.1 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  44.14 
 
 		 159 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  126  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  42.51 
 
 		 176 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  42 
 
 		 155 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  40.74 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  42.76 
 
 		 164 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.02 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.88 
 
 		 362 aa  115  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.05 
 
 		 344 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  38.67 
 
 		 156 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  43.54 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.82 
 
 		 369 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.47 
 
 		 369 aa  108  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  23.33 
 
 		 615 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.05 
 
 		 369 aa  107  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.74 
 
 		 380 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.25 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.34 
 
 		 379 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  25.53 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 		 373 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.05 
 
 		 367 aa  104  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 		 379 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 		 379 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.24 
 
 		 379 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.4 
 
 		 380 aa  103  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.9 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  39.35 
 
 		 161 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.53 
 
 		 378 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.18 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  40.27 
 
 		 153 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.69 
 
 		 376 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.3 
 
 		 357 aa  100  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.44 
 
 		 370 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.85 
 
 		 382 aa  99.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.44 
 
 		 392 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  36.57 
 
 		 189 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.44 
 
 		 392 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  38.89 
 
 		 172 aa  99.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.7 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.91 
 
 		 381 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.08 
 
 		 392 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.42 
 
 		 371 aa  97.8  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.3 
 
 		 372 aa  97.4  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.32 
 
 		 375 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.56 
 
 		 379 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.63 
 
 		 371 aa  97.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 		 379 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.44 
 
 		 388 aa  97.1  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.63 
 
 		 371 aa  97.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.93 
 
 		 379 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 371 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.59 
 
 		 376 aa  97.1  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.82 
 
 		 370 aa  97.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.85 
 
 		 379 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.38 
 
 		 382 aa  96.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>