More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1090 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
373 aa  778    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  97.86 
 
 
373 aa  764    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  98.66 
 
 
373 aa  769    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.82 
 
 
373 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.47 
 
 
376 aa  588  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  75 
 
 
374 aa  586  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.24 
 
 
372 aa  568  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.71 
 
 
388 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.24 
 
 
373 aa  548  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.83 
 
 
372 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 
379 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
375 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
373 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
372 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.47 
 
 
372 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
407 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 
370 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 
377 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.02 
 
 
373 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 
386 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
373 aa  364  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
373 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 
371 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 
375 aa  361  9e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.73 
 
 
355 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 
374 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
379 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.34 
 
 
370 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.47 
 
 
374 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
392 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
372 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
367 aa  346  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
379 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
371 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
394 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.77 
 
 
367 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.2 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
379 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
379 aa  339  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
379 aa  339  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.72 
 
 
373 aa  338  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.75 
 
 
376 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.78 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.55 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.59 
 
 
357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
376 aa  335  5.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
371 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
371 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.31 
 
 
381 aa  335  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.5 
 
 
376 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.9 
 
 
382 aa  333  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.24 
 
 
374 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.84 
 
 
380 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.63 
 
 
369 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.23 
 
 
383 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 
384 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.06 
 
 
384 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
372 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.84 
 
 
379 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.31 
 
 
374 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.18 
 
 
394 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.94 
 
 
376 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.8 
 
 
447 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.82 
 
 
392 aa  328  6e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.8 
 
 
395 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.18 
 
 
397 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.8 
 
 
395 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.82 
 
 
370 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.09 
 
 
385 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.96 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.96 
 
 
369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.94 
 
 
376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.94 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.77 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.92 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.39 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.18 
 
 
376 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.46 
 
 
383 aa  326  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.97 
 
 
382 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.57 
 
 
391 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.65 
 
 
472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.39 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>