More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0497 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  72.29 
 
 
774 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  97.5 
 
 
841 aa  1660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
841 aa  1737    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  71.32 
 
 
572 aa  795    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  70.93 
 
 
756 aa  800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  61.06 
 
 
785 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  54.04 
 
 
886 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  69.53 
 
 
794 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  43.1 
 
 
975 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  69.73 
 
 
778 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  72.09 
 
 
907 aa  807    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  71.51 
 
 
788 aa  806    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  71.12 
 
 
755 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  68.65 
 
 
792 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  72.09 
 
 
748 aa  807    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  43.81 
 
 
901 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  67.64 
 
 
730 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  81.47 
 
 
838 aa  1439    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  97.38 
 
 
841 aa  1659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  50.39 
 
 
780 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  49.3 
 
 
757 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  50 
 
 
731 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  49.11 
 
 
734 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  49.8 
 
 
731 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  48.71 
 
 
734 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  49.61 
 
 
777 aa  512  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  49.11 
 
 
796 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  46.65 
 
 
687 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  46.12 
 
 
741 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  46.12 
 
 
741 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  45.73 
 
 
689 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  46.12 
 
 
689 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  45.15 
 
 
741 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  45.63 
 
 
646 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  44.84 
 
 
643 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  43.59 
 
 
645 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.62 
 
 
724 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  42.83 
 
 
683 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  44.07 
 
 
743 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  42.83 
 
 
769 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  42.41 
 
 
730 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  43.17 
 
 
729 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 
771 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  43.17 
 
 
729 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 
775 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  42.41 
 
 
753 aa  415  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 
775 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 
775 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  41.93 
 
 
683 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  41.33 
 
 
775 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 
775 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  41.33 
 
 
775 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  41.33 
 
 
775 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  42.22 
 
 
712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  41.17 
 
 
714 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  42.02 
 
 
735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 
676 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  33.25 
 
 
794 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  41.35 
 
 
1981 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  41.75 
 
 
725 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.25 
 
 
767 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 
767 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 
783 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  39.96 
 
 
540 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  31.42 
 
 
822 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 
968 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  38.55 
 
 
916 aa  360  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  38.55 
 
 
874 aa  360  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  38.55 
 
 
922 aa  360  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  38.29 
 
 
619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  38.48 
 
 
618 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  36.16 
 
 
1057 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  37.55 
 
 
1048 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  38.55 
 
 
645 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  29.92 
 
 
826 aa  347  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  36.95 
 
 
1048 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  30.68 
 
 
843 aa  346  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  30.7 
 
 
845 aa  345  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 
869 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  36.78 
 
 
872 aa  344  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 
930 aa  343  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 
858 aa  343  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 
896 aa  343  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 
875 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  36.45 
 
 
618 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  36.53 
 
 
641 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  30.52 
 
 
845 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.36 
 
 
661 aa  334  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  37.16 
 
 
616 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  35.93 
 
 
618 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 
661 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 
661 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.55 
 
 
661 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 
661 aa  332  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>